中国农业大学植物生态工程研究所集科研、开发、生产、推广于一体，主要从事植物土传病害、有益内生菌、生物防治、农产品安全生产、植物微生态学、植物生态病理学等方面的研究，已有近50年的历史。先后承担国家自然科学基金、863、国家攻关计划等项目50余项，出版专著15部，发表论文200余篇。培养硕士研究生30多名，博士生15名。获得国家发明专利12项，国家及省部级各种奖励30余项。本研究所发明的益微系列产品，已在全国31个省、市推广，面积达10亿亩，增产粮食150亿公斤，增加产值100亿元。益微的发展已形成独立的体系，包括一个学科：植物微生态学；二条技术路线：微生态调控和生物防治；四个支柱工程：生态工程、遗传工程、发酵工程、代谢工程；五大系列产品：植物、动物、人用、环保、生物药业等益微系列产品。植物微生态学已经发展为一个独立的学科，并保持国际领先地位。国家科技部1995年正式批准在该研究所的基础上成立国家增产菌研究及推广中心。